Quand on fait des milliers d'analyses par semaine d'ADN par semaine, la contamination des échantillons d'analyse est la hantise de tout chercheur. Des résultats aléatoires ou faussés peuvent compromettre des mois de travail par une mauvais protocole de manipulation.
«En général, les analyses de génotypage par séquençage (GBS)) sont réalisées sur des plaquettes de 96 puits accueillant autant de tubes dans lesquels sont placés le matériel génétique et les réactifs permettant de préparer les échantillons pour le séquençage. Comme cinq ou six produits sont ajoutés de façon séquentielle dans
chaque tube et qu'il faut changer l'embout des pipettes chaque fois pour
éviter la contamination, le volume de déchets plastiques augmente très
rapidement»
Le volume de déchets finit donc par être un vrai problème, surtout si on considère l'ensemble des laboratoires au pays.
La solution réside à la fois dans la réduction des volumes des échantillons et dans le procédé de manipulation. L'éjection acoustique par gouttelettes - NanoGBS - est un procédé qui permet de générer de petits volumes de solutions avec grande précision et est surtout utilisé dans l'industrie pharmaceutique. Une adaptation a permis de l'utiliser dans les laboratoires de génomique avec comme effet de réduire le volume des déchets de 90 %, d’accélérer les analyses et de réduire les coûts de 70 %.
Bref, on y gagne sur toute la ligne.
Pour l'article complet : Une méthode d'analyse génomique qui diminue de 90% les déchets plastiques - Jean Hamann
Plate-forme d'analyse génomique IBIS - Université Laval - https://www.ibis.ulaval.ca/services/analyse-genomique/
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